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Cell北京大学张泽民团队综述肿瘤基因组学的重要成果与发展方向 肿瘤基因组学（Cancer genomics）旨在系统性地发现肿瘤发生发展过程中的分子驱动机制，理解肿瘤异质性的生物学基础，并据此提供个体化的精准治疗策略。过去20年，得益于高通量测序技术的发展与普及，肿瘤基因组学推动了肿瘤生物学的革命性变化，极大丰富了我们对癌细胞自身、以及整个肿瘤微环境的理解，并为肿瘤治疗提供了新的可行方案。 2023年4月13日，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）张泽民教授受邀于 Cell 发表了题为：Accelerating the understanding of cancer biology through the lens of genomics 的综述文章。 该综述全面总结了肿瘤基因组学的发展历程以及其对理解肿瘤驱动机制与异质性、促进个体化精准肿瘤治疗的重要贡献，并强调了目前肿瘤基因组学研究视野的转化，即从对癌细胞本身特性的关注提升到对整个肿瘤“生态系统”的研究，最后讨论了肿瘤基因组学未来在推动基础肿瘤生物学理解与临床转化应用方面潜在的发展方向。 张泽民教授 张泽民教授，北京大学生物医学前沿创新中心（BIOPIC）主任，北京大学生命科学学院讲席教授，北大清华联合中心高级研究员。2023年作为创始人建立百奥智汇科技有限公司，致力于挖掘单细胞基因组学和生物信息学在人类疾病诊断和治疗上的应用。曾任Genentech公司生物信息部主任、首席科学家与ROCHE公司生物信息首席科学家。先后在国际上首次建立了肝癌、肺癌和结肠癌单细胞免疫图谱，拥有60项美国以及众多欧洲专利，其中有7项药物已进入临床试验。张泽民实验室致力于用前沿的基因组学和生物信息学技术来解决癌症生物学中的重要问题，结合计算（干）和实验（湿）方法来揭示肿瘤发生过程、微环境和对药物响应中的系统变化和具体遗传因素，以推进癌症免疫治疗和靶向治疗的发展。 该综述文章首先总结了肿瘤基因组学在理解癌细胞致癌机制、分子特征以及癌症的分型与精准治疗方面的里程碑式发现。2023年，张泽民教授团队在国际上首次完成人类实体瘤的全基因组测序，使得在全基因组水平上研究不同类型的致癌突变成为可能。 根据致癌突变对患者进行分型推动了精准、靶向治疗的发展，例如具有EGFR突变的非小细胞肺癌患者、BRAF突变的黑素瘤患者可以对相应靶向药产生临床响应。国际合作计划TCGA、ICGC通过整合大规模、多组学测量的基因组数据，在泛癌种水平上揭示了主要的致癌规律与癌症的分子分型。基于前期的发展，文章总结了肿瘤基因组学的发展趋势，强调了样本规模、测量维度与检测分辨率对理解癌症分子机制的重要意义。 肿瘤异质性是阻碍有效肿瘤治疗的关键因素，理解肿瘤内部的分子异质性是肿瘤基因组学的核心问题。传统bulk样本能够揭示不同患者间致癌突变的差异，却难以精确定义样本内部的异质性。2023年，对同一患者肿瘤的多区域采样与分析揭示了肿瘤内部致癌突变分布的空间异质性。而单细胞全基因组测序技术，例如LIANTI等技术的发展为肿瘤异质性研究带来了新的机遇。自此，我们得以从单细胞水平上追踪癌细胞的演化历程与致癌基因的异质性，这为理解并攻克肿瘤患者对不同治疗方式的抗药性提供了新的可能性。 2023年，肿瘤免疫检查点抑制疗法正式被FDA批准并在临床取得巨大成功。在理解癌细胞异质性的基础上，研究整个肿瘤生态系统尤其是免疫微环境的特征与异质性成为肿瘤基因组学新的发展方向。在2023年， 本文来源：https://www.dywdw.cn/2b9702a45bf5f61fb7360b4c2e3f5727a5e924b1.html
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2023-04-26
