箱式图及散点图解释

2023-03-24 03:03:10   第一文档网     [ 字体: ] [ 阅读: ] [ 文档下载 ]
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1 Figure 1A: what is the meaning of the red and blue bars? 红的和蓝的表示什么意思?

.

答复:Box plot是比较数据间的分布差异,中位数和散布大小的比较,目的是为了看芯片数据的均一性情况,具体原理或图示的意义详见下图示例: 即蓝色的区域为数据中心及上下四分位值,红色为异常点





2 关于下面的散点图,

1 yEXP(全称?请注明)代表实验组癌组织?XCON(全称?请

注明)代表对照组癌旁组织?


2

关于X(或Y代表的到底是两个样本间的比较还是两个组之间的比

较?你们前次回答是组间比较。但你们的图片注释却是:The values of X and Y axes in the Scatter-Plot are the normalized signal values of the samples (log2 scaled) or the averaged normalized signal values of groups of samples (log2 scaled).



答复:关于散点图,详见如下示例:

Y轴:代表实验组,即癌组织组,用的是每个lncRNA在实验组各样品中标准值的平均值(即Group Exp-Normalized;

X轴:代表对照组,即癌旁组织组,用的数据是每个lncRNA在对照组各样品中标准值的平均值(即Group Con-Normalized

通过组间比较即用两组的平均标准值作图,可直观地看到差异大于2倍的lncRNA的数量多寡




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